Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prelid3bQ9CYY7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms