Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssu72Q9CY97 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssu72Q9CY97 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssu72Q9CY97 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms