Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtpbp8Q9CY28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms