Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms