Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms