Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yif1bQ9CX30 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms