Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms