Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms