Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms