Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms