Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms