Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca4Q9CWM2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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