Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Raver1Q9CW46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Raver1Q9CW46 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms