Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms