Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms