Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ranbp3Q9CT10 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ranbp3Q9CT10 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms