Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms