Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tma16Q9CR02 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms