Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms