Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms