Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQM1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms