Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms