Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms