Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms