Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl39lQ9CQD0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms