Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd1Q9CQA6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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