Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQ90 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms