Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb3bpQ9CQ82 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms