Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms