Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Use1Q9CQ56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Use1Q9CQ56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms