Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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