Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms