Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms