Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim26Q99PN3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms