Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd3Q99PL7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms