Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4rQ99PI8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4rQ99PI8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms