Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms