Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms