Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NsmfQ99NF2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms