Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms