Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms