Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel1Q99MW3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms