Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf17Q99MV7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms