Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp1b4Q99ME6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b4Q99ME6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms