Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tm2d1Q99MB3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tm2d1Q99MB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms