Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaja3Q99M87 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms