Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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