Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnps1Q99M28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnps1Q99M28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms