Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cstf3Q99LI7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms