Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms